SYNBREED T1: Genomweite Hochdurchsatz-Resequenzierung bei Huhn, Rind und Mais
Beschreibung:
Hochparallele Sequenziertechniken (next generation sequencing NGS) ermöglichen die Sequenzierung komplexer Genome in überschaubaren Zeiträumen zu Kosten, die weit unter denjenigen herkömmlicher Sequenziertechnologie liegen. Durch Investitionen aus dem Innovationscluster und aus Eigenmitteln soll die bereits am HMGU etablierte Infrastruktur zu NGS Technologien gezielt ausgebaut werden. Die Geräte erlauben sowohl die Identifizierung von Basenpaaraustauschen (SNPs) als auch von Kopienzahlvarianten (copy number variants CNVs). Die geplanten Sequenzierungen von DNA-Pools und Einzelindividuen bei Huhn, Rind und Mais bilden die Grundlage für die Identifizierung von Sequenzpolymorphismen für die Erstellung von SNP-Arrays, liefern Beiträge zur Vervollständigung der Genomsequenzen von Huhn, Rind und Mais und bilden neben den Hochdurchsatz-Genotypisierungsdaten die Datengrundlage für das Anwendungsprojekt Populationsgenomik (A4).
Ausführendes Institut:
Institut für Humangenetik Details von Institut für Humangenetik
Übergeordnete Institution:
Technische Universität München (TUM) Details von (TUM) (Bayern)
Laufzeit:
01. 01. 2009 - 31. 12. 2014
Mitwirkende Institutionen:
- Helmholtz Zentrum München, GmbH Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GSF) Details von GSF
Verbundprojekt:
Kompetenznetzwerk SYNBREED Details von Kompetenznetzwerk SYNBREED
Förderprogramm:
- BMBF - Kompetenznetze in der Agrar- und Ernährungsforschung Details von BMBF - Kompetenznetze in der Agrar- und Ernährungsforschung
Fachgebiet:
- Pflanzenzüchtung
- Tierzucht
Forschungszweck:
Grundlagenforschung
Förderer:
- Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF) Details von (BMBF)
Träger:
- Projektträger Jülich (PTJ) Details von PTJ
