Moderne molekulare Diagnostikmethoden: Ultraschnelle Ad-Hoc-Pathotypisierung und Charakterisierung von AIV-Gesamtgenomen
Beschreibung:
AIV-Isolate werden nicht nur verschiedenen Subtypen, sondern auch zwei Pathotypen (niedrig pathogen = LPAI; hoch pathogen = HPAI) zugeordnet. Nur HPAI-Viren können Geflügelpest auslösen und nur HPAI H5N1 weist ein humanpathogenes Potential auf. Für AIV ist dabei insbesondere die Sequenz der Hämagglutinin-Spaltstelle entscheidend und eine Sequenzanalyse ist zur Klassifizierung notwendig. Ziel des Projektes ist die Etablierung eines Verfahrens, das auf Basis einer hochdurchsatzfähigen massenspektrometrischen Analyse sehr schnell die Bestimmung des vorliegenden Serotyps und die Zuordnung zu einem bestimmten Pathotyp erlaubt. Für die Analyse anderer Genomabschnitte (z.B. einzelne Aminosäureaustausche, phylogenetische Untersuchungen im Rahmen einer molekularen Epidemiologie), aber auch Interspezies-Transmission, sind zudem schnelle Vergleiche von Gesamtgenomsequenzen unerlässlich. Die DNS-Sequenzierung mit ultrahohem Durchsatz mit Hilfe der neuen Technik des Genome Sequencer 20 (Roche), soll für die AIV-Diagnostik und Charakterisierung weiterentwickelt und validiert werden.
Ausführendes Institut:
FLI - Institut für Virusdiagnostik (FLI - IVD) Details von FLI - Institut für Virusdiagnostik
Übergeordnete Institution:
Friedrich-Loeffler-Institut - Bundesforschungsinstitut für Tiergesundheit (FLI) Details von (FLI) (Mecklenburg-Vorpommern)
Laufzeit:
01. 09. 2006 - 31. 08. 2009
Projektbudget:
1.729.605 €
Mitwirkende Institutionen:
- FLI - Institut für Molekularbiologie (FLI-IMB) Details von FLI-IMB
Förderprogramm:
- BMELV - Programm zur Innovationsförderung Details von BMELV - Programm zur Innovationsförderung
Fachgebiet:
- Tiergesundheit
- Spezielle Tierarten
- Wildbiologie
- Biotechnologie
Forschungszweck:
Innovationsförderung
Förderer:
- Bundesministerium für Ernährung, Landwirtschaft und Verbraucherschutz (BMELV) Details von (BMELV)
Träger:
- Bundesanstalt für Landwirtschaft und Ernährung (BLE) Details von BLE