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Identifikation, Modifikation und Nutzung von Resistenzen gegen bedeutende Pathogene der Gerste (IdeMoDeResBar)

Projekt

Produktionsverfahren

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Produktionsverfahren


Förderkennzeichen: JKI-RS-08-3399
Laufzeit: 01.01.2017 - 31.10.2019
Forschungszweck: Angewandte Forschung

Ziel des Projektes IdeMoDeResBar ist die Isolation neuer bislang nicht nutzbarer Hauptgene und Quantitative Trait Loci, welche Resistenz gegen die Gelbmosikvirose der Gerste (BaMMV/BaYMV), gegen den Zwergrost (Puccinia hordei), gegen Netzflecken (Pyrenophora teres) und Rhynchosporium-Blattflecken (Rhynchosporium commune) bedingen, sowie die Editierung zweier bereits isolierter Resistenzgene gegen die Gelbmosaikvirose. Einerseits wird dies zu einem vertieften Verständnis der Funktion von Resistenzgenen führen, und andererseits eine gezieltere Nutzung genetischer Ressourcen - als Voraussetzung für die Züchtung resistenter Sorten und damit verbunden einer umwelt- und verbraucherfreundlichen Gerstenproduktion - ermöglichen.

Das Vorhaben ist in 4 Arbeitspakete unterteilt, d.s. (i) die Feinkartierung der bearbeiteten Loci, die Erstellung physikalischer Karten und die Identifikation von Kandidatengenen, (ii) die bioinformatische Analyse mittels verbesserter Algorithmen und die Datenintegration, (iii) die funktionelle Analyse der Kandidatengene und die Editierung zweier isolierter Resistenzgene gegen die Gelbmosaikvirose, (iv) die markergestützte Rückkreuzung der Resistenzen und die Nutzung in Hybridzüchtungsprogrammen. Im Rahmen der Genisolation werden aktuelle genomische Verfahren wie Genotyping by Sequencing (GBS) oder Renseq eingesetzt bzw. genomische Resourcen wie ExomeCapture Daten und die aktuellste Gersten-Referenzsequenz genutzt. Für die funktionelle Analyse von Kandidatengenen und die in planta Generierung von Resistenzallelen in Elite-Material werden wir eine etablierte Plattform RNA-vermittelter CAS Nukleasen einsetzen. Für die Nutzung der entsprechenden Resistenzen werden rückgekreuzte Linien mit den kürzesten resistenztragenden Fragmenten identifiziert und in der Entwicklung moderner Sorten und Hybridsorten genutzt.

Zwergrost und Bodenburtige Mosaikviren sind bedeutende Krankheiten der Gerste. Die Identifikation von Resistenzgenen ist eine umweltschonende Möglichkeit, um Ertragsverluste zu vermeiden. Ziel dieses Projektes ist die Feinkartierung und Isolation der Resistenzgene RpHMBR12 und rym15. In Bezug auf RphMBR1012 wurden 4775 F2 Pflanzen analysiert und in dem Zielinterval (0,44 Mb) konnten 55 Marker kartiert und 29 Gene identifiziert werden. Für rym15 wurde mit 527 F2 Pflanzen eine erste genetische Karte erstellt und das rezessive Resistenzgen rym15 einem Markerintervall von 140 Mb zugeordnet. Der Lokus soll zukünfitg auf 5000 F2 Pflanzen feinkartiert werden.

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