Logo des Forschungsinformationssystems Agrar und Ernährung

Forschungsinformationssystem Agrar und Ernährung

Informationsportal des Bundes und der Länder

Identifikation von Genen und Indikatoren für Trockentoleranz der Gerste (Hordeum vulgare)

Projekt

Produktionsverfahren

Dieses Projekt leistet einen Beitrag zum Forschungsziel „Produktionsverfahren“. Welche Förderer sind dazu aktiv? Welche Teilziele gibt es dazu? Schauen Sie nach:
Produktionsverfahren


Förderkennzeichen: JKI-RS-08-3375
Laufzeit: 01.03.2013 - 29.02.2016
Forschungszweck: Angewandte Forschung

Das Gesamtvorhaben beabsichtigt, durch Integration genetischer Informationen (QTLs) in physiologisch basierte Bestandeswachstumsmodelle die phänotypische Reaktion von Gerstengenotypen auf Trockenstress in verschiedenen Umwelten vorherzusagen. Trockenstress stellt bei Gerste weltweit, aber auch unter vielen Anbaubedingungen in Deutschland einen der wesentlichen ertragslimitierenden Faktoren dar. Ziel des Teilprojektes 'Identifikation von Genen und Indikatoren für Trockentoleranz der Gerste (Hordeum vulgare)' ist es, mittels assoziationsgenetischer Verfahren QTL zu identifizieren, die an der Trockentoleranz der Gerste beteiligt sind. Für diesen Zweck werden 192 genetisch diverse Sommergersten mit einer großen Anzahl von SNP-Markern genotypisiert. Zusätzlich zu diesem genomweiten Ansatz werden aus der Literatur bekannte Kandidatengene für Trockentoleranz allelspezifisch sequenziert und in die Assoziationsstudien einbezogen. Um des weiteren genotypische Unterschiede in der Expression von trockentoleranzassoziierten Gene zu ermitteln, werden die extremen Genotypen der Population mittels Real-Time PCR analysiert. Die Phänotypisierungen dieser Genotypen erfolgen bei den Projektpartnern im Hinblick auf die Reaktion auf Trockenstress in der vegetativen und generativen Entwicklungsphase. Die auf diese Weise generierten phänotypischen und genotypischen Daten bilden die Grundlage für die assoziationsgenetische Identifikation von QTL für Trockentoleranz bei Gerste, welche gemeinsam mit den phänotypischen und genotypischen Daten Eingang in die Modellierungsarbeiten finden. Es wird erwartet, dass die Arbeiten einen Beitrag zum Verständnis der Genetik der Trockentoleranz der Gerste leisten und basierend auf diesen Erkenntnissen dieses Merkmal effektiv züchterisch verbessert werden kann, sowie anhand der identifizierten QTL eine Modellierung der Ertragsbildung von Gerste unter Trockenstress möglich sein wird. Die verwendeten Sommergersten aus dem Diversitätsset des IPK Gatersleben wurden als Vorarbeit zu diesem Projekt in der Vegetationsperiode 2010 am Standort Groß Lüsewitz vermehrt sowie ebenfalls bereits mit 1536 Illumina Markern, 1935 DArT-Markern und dem 9kiSelect Chip genotypisiert. Diese Daten stehen für das laufende Projekt zur Verfügung. Im Teilprojekt 'Identifikation von Genen und Indikatoren für Trockentoleranz der Gerste (Hordeum vulgare)' wurden in einem ersten Schritt in Zusammenarbeit mit dem IPK Gatersleben 189 genetisch diverse Sommergersten mittels Genotyping-by-Sequencing (GBS) genotypisiert. Dazu wurde zunächst eine GBS-Bank erstellt und diese in einer HiSeq lane (1 x 100 cycles) über Sequencing by synthesis (SBS) sequenziert. Als nächstes soll die Auswertung der Sequenzdaten (20GB) erfolgen. Es wird erwartet, dass mit der Anzahl der generierten Marker die für eine genomweite Assoziationsstudie nötige Markerabdeckung erzielt werden kann.

mehr anzeigen weniger anzeigen

Fachgebiete

Erweiterte Suche