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Assoziationsgenetische Kartierung von Resistenzen gegen die Netz- und Braunfleckenkrankheit in einem Gerstesortiment aus den Diversitätszentren
Projekt
Förderkennzeichen: JKI-RS-08-3387
Laufzeit: 01.02.2015
- 31.12.2017
Forschungszweck: Grundlagenforschung
Die Ziele des vorliegenden Projektes sind daher (i) die genetische Diversität der Resistenz gegenüber P. teres f. teres, und P. teres f. maculata sowie gegenüber C. sativus zu erfassen und QTL in einer repräsentativen Gerstensammlung mittels genomweiter Assoziationsstudien (GWAS) zu identifizieren, (ii) Erkenntnisse über die Stabilität und Übertragbarkeit dieser QTL mittels der Integration ausgewählter Marker in bestehende bereits phänotypisierte DH-Populationen zu gewinnen, (iii) diese QTL mit Markern abzusättigen und diese in die physikalische und sequenzbasierte Karte der Gerste, als ersten Schritt im Hinblick auf die Identifikation von Kandidatengenen zu integrieren, (iv) die Nutzung dieser QTL in der Gerstenzüchtung durch die Entwicklung einfacher und kostengünstiger PCR Marker zu ermöglichen.
Um diese Ziele zu erreichen, werden 450 Gersteakzessionen am JKI und am VIZR im Hinblick auf Resistenz durch die Inokulation mit verschiedenen Isolaten von P. teres f. teres, und P. teres f. maculata sowie C. sativus aus Russland und Deutschland inokuliert, so dass detaillierte Resistenzdaten für die Assoziationsstudien vorliegen. Die Genotypisierung wird mittels des 9k iSelect Chips sowie mittels Genotyping by Sequencing (GBS), welches am JKI momentan etabliert wird, durchgeführt und die Populationsstruktur mittels 2 SSRs pro Chromosomenarm bestimmt. GWAS werden mittels eines Mixed Linear Models durchgeführt und mit diesem Verfahren Regionen identifiziert, welche in die Resistenz gegenüber den oben genannten Pathogenen involviert sind. Diese Regionen werden mit molekularen Markern abgesättigt als ersten Schritt in Richtung auf eine Genisolation. Unter Nutzung dieses Ansatzes werden detaillierte Erkenntnisse über die genetische Diversität der Resistenz gegen die genannten Pathogene gewonnen und eine gezielte Nutzung dieser in der Gerstenzüchtung sichergestellt.
Abschnittsübersicht
Fachgebiete
- Pflanzenzüchtung
