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Identifizierung transgener Integrationen in einer frühblühenden Apfellinie zur Prüfung der FastBreeding-Technologie im Hinblick auf deren Anwendbarkeit in der praktischen Sortenzüchtung

Projekt


Förderkennzeichen: JKI-ZGO-08-4206
Laufzeit: 01.07.2017 - 31.12.2018
Forschungszweck: Angewandte Forschung

Mit dem Ziel, die FastBreeding-Technologie im Hinblick auf eine mögliche Anwendung unter den in der EU geltenden GVO-Regulierungen zu prüfen, sollen die Genome der nicht transgenen Ausgangslinie PinS und der transgenen Mutterpflanze T1190 mit Hilfe einer PacBio-basierten Strategie sequenziert werden. Anschließend werden die mittels PacBio erzeugten Sequenzdaten sowie bereits verfügbare Illumina-HiSeq2000-Sequenzdaten verglichen. Dabei soll untersucht werden, ob die Linie T1190 außer der bekannten T-DNA-Integration weitere, bislang unentdeckte Integrationen fremder DNA besitzt.

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