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Impressum
Etablierung und Erweiterung einer Galaxy-Instanz
Projekt
Förderkennzeichen: JKI-SG-08-2211
Laufzeit: 01.10.2012
- 30.09.2018
Forschungszweck: Bestandsaufnahme & Abschätzung
Die Bearbeitung bioinformatischer Fragestellungen setzt in vielen Fällen den Umgang mit dem Betriebssystem Linux, Kommandozeilenprogrammen und Hochleistungsrechnern voraus. Zudem ist es erforderlich Programme nacheinander auszuführen und über gemeinsame Schnittstellen mit einander zu verknüpfen. Das Workflow Management System Galaxy bietet eine Möglichkeit diese Anforderungen zu reduzieren und bietet eine nutzerfreundliche und plattformunabhängige Benutzeroberfläche. Im Rahmen des Projekts soll untersucht werden, in wieweit Galaxy sich eignet und erweitern lässt, um die für das JKI relevanten bioinformatischen Fragestellungen zu beantworten.
Abschnittsübersicht
Fachgebiete
- Pflanzenschutz
- Biotechnologie
- Informatik
Rahmenprogramm
Förderprogramm
Ausführende Einrichtung
Institut für die Sicherheit biotechnologischer Verfahren bei Pflanzen (JKI-SB)
