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Charakterisierung von Colistin resistenten Salmonella Stämmen, Untersuchung auf mcr Gene und Erforschung neuer Resistenzdeterminaten

Projekt


Förderkennzeichen: BfR-BIOS-08-1322-715
Laufzeit: 01.01.2019 - 31.12.2019
Forschungszweck: Experimentelle Forschung

Das Polymyxin-Antibiotikum Colistin gehört zu den Reserveantibiotika. Als Liu et al. 2015 das erste Plasmid-kodierte und somit übertragbare Colistin-Resistenzgen (mcr-1) entdeckt haben, ist Colistin-Resistenz in Bakterien aus Patienten, Nutztieren und Lebensmitteln wieder vermehrt in den Fokus des öffentlichen Gesundheitswesens, der Tiergesundheit und der Lebensmittelsicherheit gerückt. Seitdem wurden sieben weitere mcr-Gene (mcr-2 bis mcr-8) beschrieben. Ein umfassendes mcr-1 PCR Screening von 432 Colistin-resistenten Salmonella Isolaten (MIC 2 mg/L) aus Nutztieren und Lebensmitteln, eingesandt ans NRL Salmonella zwischen 2011 und 2018, hat ergeben, dass 47% der Isolate das mcr-1-Gen tragen. Sequenzierung von mcr-1-negativen Isolaten im Rahmen des ENGAGE Projekts hat zudem zur Entdeckung des mcr-5 Gens geführt. Ein erweitertes PCR Screening für die Gene mcr-2 bis mcr-5 hat gezeigt, dass mcr-4 in 13% und mcr-5 in 5% der analysierten Isolate identifiziert werden konnte. Keines der Isolate war positiv für mcr-2 und mcr-3. Die mcr positiven Isolate gehören zu verschiedenen Serovaren und stammen aus der Primärproduktion (Geflügel, Schwein, Rind) und aus Lebensmitteln (Schweinefleisch, Geflügelfleisch). Im Folgenden soll das Screening auf neue mcr Gene (mcr-6 bis mcr-8) erweitert werden. Zudem sollen ausgewählte Salmonella Isolate mittels Gesamtgenomsequenzierung untersucht werden. Ziel dabei ist es, Übertragungswege bekannter mcr Gene entlang der Lebensmittelkette aufzudecken und nach bisher unbekannten Resistenzmechanismen zu suchen. Das Projekt ist auf zwei Jahre ausgelegt.

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