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Verbundvorhaben: Strukturelle Genomvariation, Haplotypendiversität und das Gerste Pan-Genom - Erforschung der strukturellen Genomdiversität für die Gerstezüchtung. Teilprojekt B (SHAPE)

Projekt


Förderkennzeichen: 031B0190B
Laufzeit: 01.11.2016 - 31.10.2019
Fördersumme: 180.902 Euro
Forschungszweck: Angewandte Forschung

Das interdisziplinäre Projekt SHAPE befasst sich mit der Aufklärung der Komplexität struktureller Variation sowie der Bestimmung des sogenannten Core- und des Pan-Genoms der Gerste. Anhand der neu erzeugten Genominformationen, sowie unter Berücksichtigung vorhandener Genomdaten werden Ansätze entwickelt und überprüft, um zu klären, welche Bedeutung oder welchen Einfluss die Kenntnis über strukturelle Variation auf den Erfolg genomischer Selektion in einem Gerste-Zuchtprogramm haben kann. Das Projekt wird, in bisher unerreichtem Maße, die Komplexität genetischer und struktureller Variation des Gerste Genoms beschreiben und in Zusammenarbeit mit einer der führenden Getreide Züchtungsfirmen Deutschlands und Europas, für eine nachhaltige Gerste-Züchtung erschließen. Potential und Nutzen der erzeugten, hochdichten und hochauflösenden, genomischen Variations-Matrix für eine Anwendung in der Assoziations Genetik und für Genom weite Vorhersagen in einem modernen Gerste Züchtungsprogramm werden demonstriert. Es wird außerdem gezeigt wie die neu erzeugte Information genutzt werden kann, um sehr diverse aber kompatible Haplotypen aus Sammlungen genetischer Ressourcen zu rekrutieren und so eine vorhersagbare und damit besser planbare Zunahme genetischer Diversität in Zuchtprogrammen erreicht werden kann.

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