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Molekulare Typisierung als Ersatzmethode zur serologischen Bestimmung von Geißelanti-genen bei E. coli
Projekt
Förderkennzeichen: BfR-BIOS-08-1322-484
Laufzeit: 01.03.2011
- 31.12.2011
Forschungszweck: Angewandte Forschung
Als Darmbakterium kann Escherichia coli in faktisch jedem Untersuchungsmaterial vorkommen. Die Erkennung pathogener E. coli beruht auf der Bestimmung der Virulenzfaktoren. Epidemiologische Untersuchungen zu Übertragungswegen, Ausbrüchen und anderer Infektketten werden durch Serotypisierung der Erreger durchgeführt. Die serologische Bestimmung der O und H Antigene hat jedoch folgende Nachteile: 1) Entsprechende Antiseren sind nicht für jedes Labor verfügbar 2) falsch positive und falsch negative Reaktionen sind nicht selten 3) Die H-Serotypisierung ist zeitaufwendig (>1 Woche) 4) Tierversuche sind zur Herstellung von Seren erforderlich 5) Unbewegliche und raue Stämme können serologisch nicht typisiert werden. Die DNA PCR basierte Bestimmung der O- und H-Antigene umgeht diese Nachteile vollständig. Als Instrument kann sie in jedem modernen Labor durchgeführt werden. Die Vervollständigung der DNA basierten H-Antigen Bestimmung leistet daher einen wertvollen Dienst bei der Erkennung und Beschreibung von Krankheitserregern, der Identifizierung serologisch nicht bestimmbarer Stämme und für den Tierschutz.Die Ausweitung der auf fliC-Typisierung basierten Detektion von H-Antigentypen von Escherichia coli soll durch Einbeziehung von neun Non-fliC-codierten H-Typen (H3, H17, H35, H36, H44, H47, H53, H54 und H55) vervollständigt werden. Hierzu sollen spezifische PCR Detektionssysteme für die neun Non-fliC-kodierten H-Antigene entwickelt werden sowie gruppenspezifische Detektionssysteme, die diese neun H-Antigene erfassen. Das Ziel ist eine komplette PCR/RFLP basierte Bestimmungsmethode für sämtliche 53 bekannten H-Antigene von E. coli.
Abschnittsübersicht
Fachgebiete
- Tiergesundheit
