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Untersuchungen zur Funktion des AvrRpt2Ea Effektorproteins in der Wirt-Pathogen-Interaktion Malus x robusta 5-Erwinia amylovora
Projekt
Förderkennzeichen: JKI-ZGO-08-4177
Laufzeit: 01.01.2015
- 31.12.2017
Forschungszweck: Angewandte Forschung
Im Rahmen des Projektes soll die Rolle des AvrRpt2EA-Effektorproteins in der Wirt-Pathogen-Interaktion Malus ×robusta 5-Erwinia amylovora näher untersucht werden. In einem ersten Schritt werden die allgemeinen und spezifischen Auswirkungen von AvrRpt2EA auf die Wirtspflanze untersucht. Dafür werden Inokulationsexperimente mit einem AvrRpt2EA komplementierten Pseudomonas Stamm durchgeführt. Dabei soll geklärt werden, ob AvrRpt2EA effektiv in die Apfelzelle sekretiert wird. Danach werden die inokulierten Pflanzen auf das Vorkommen von möglichen Symptomen untersucht. Parallel dazu erfolgen Untersuchungen zu den Effekten des AvrRpt2EA-Proteins auf die Wirtspflanze mithilfe transgener Apfelpflanzen. Neben einer molekulargenetischen Charakterisierung der bereits verfügbaren Pflanzen soll die Expression des AvrRpt2EA Proteins auf transkriptioneller und post-transkriptioneller Ebene untersucht werden. Dabei werden auch alle Symptome erfasst, die in der Folge der AvrRpt2EA Expression auftreten. Darüber hinaus soll geklärt werden, ob es durch die AvrRpt2EA-Expression zu einer Blockierung der Zimtsäure-4-hydroxylase kommt und welchen Einfluss das auf den Sekundärstoffwechsel hat. In einem zweiten Schritt sollen weitere Targets von AvrRpt2EA im Apfelgenom identifiziert werden. Dafür werden in verfügbaren Datenbanken nach Apfelgenen gesucht, welche putative AvrRpt2EA-Schnittstellen enthalten. Identifizierte Gene werden getestet, ob und wo sie in der Apfelpflanze exprimiert werden. Anschließend werden diese Gene full length von cDNA amplifiziert und in binäre Pflanzentransformationsvektoren kloniert. Anhand von Co-Transformationsexperimenten in Nicotiana benthamiana soll geprüft werden, ob die putativen Schnittstellen von AvrRpt2EA erkannt werden und funktionell sind.
Abschnittsübersicht
Fachgebiete
- Pflanzenzüchtung
- Biotechnologie
Rahmenprogramm
Förderprogramm
Ausführende Einrichtung
Institut für Züchtungsforschung an Gartenbaulichen Kulturen (JKI-ZG)
