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Etablierung und Anwendung der Next Generation Sequencing (NGS) und Proteomics Technologie zur Bearbeitung von Fragestellungen der Mykotoxinbiosynthese auf der Genom-, Transkriptom- und Proteomebene
Projekt
Förderkennzeichen: MRI-OG-08-42709_NGS
Laufzeit: 01.04.2014
- 31.03.2016
Forschungszweck: Angewandte Forschung
Innerhalb dieses Forschungsprojektes soll eine NGS Sequencing Technologie etabliert werden, um Genomanalysen sowie Transkriptomanalysen von mykotoxinbildenden Pilzen, aber auch von Bakterien aus verschiedenen Habitaten durchführen zu können. Bei den mykotoxinbildenden Pilzen werden Vergleiche des Transcriptoms unter Bedingungen, die die Mykotoxinbildung fördern, bzw. hemmen, durchgeführt, um Hinweise auf spezifische Gene der Mykotoxinbildung zu bekommen. Weiterhin werden Genomsequenzierungen spezifischer mykotoxinbildender Pilze durchgeführt. Auf bakterieller Ebene werden Metagenomanalysen zur Charakterisierung von bakteriellen Populationen durchgeführt.
Das NGS system konnte in einem ersten Experiment eingesetzt werden um das Metagenom von Darmbakterien zu analysieren. Für die myktoxinbildenden Pilze konnte eine erste Genomseqeunzierung etabliert werden.
Abschnittsübersicht
Fachgebiete
- Lebensmittelmikrobiologie
- Toxikologie
Rahmenprogramm
Förderprogramm
Ausführende Einrichtung
MRI - Institut für Sicherheit und Qualität bei Obst und Gemüse (MRI-OG)
