Kompetenznetzwerk PHÄNOMICS
PHÄNOMICS - Ein systembiologischer Ansatz zur Genotyp-Phänotyp-Abbildung im Kontext von Leistung, Gesundheit und Wohlbefinden bei den Nutztieren Rind und Schwein. Nutztiere stellen eine unverzichtbare Ressource für die langfristige bedarfsgerechte Erzeugung hochwertiger Lebensmittel dar. Die weltweit wachsende Bevölkerung, der zunehmende Wohlstand in den Schwellenländern und die Änderung der Verzehrsgewohnheiten werden die Nachfrage nach Produkten tierischer Herkunft weiter steigern. Bisher konnte durch gezielte Züchtung die Leistung der Tiere deutlich erhöht werden, jedoch auf Kosten von Gesundheit und Wohlbefinden. Die zukünftige Erzeugung von Lebensmitteln tierischen Ursprungs wird zwingend die Tiergesundheit als maßgebliches Leitbild der tierischen Produktion erfordern, wobei Tiergesundheit und Wohlbefinden das Bindeglied der notwendigen Verknüpfung von Tierschutz und gesundheitlichen Verbraucherschutz darstellen. Hier setzt das nutztierspezifische Kompetenznetz PHÄNOMICS an, welches im Mai 2010 startete und exzellente Kompetenzen der funktionellen Genomanalyse, der Tierzucht- und Veterinärwissenschaften, der Haustiergenetik, der Verhaltensbiologie, der Tierhaltung, der Bioinformatik und Biomathematik zusammengeführt. Das Netzwerk wird durch die Agrar- und Umweltwissenschaftlichen Fakultät der Universität Rostock koordiniert und besteht aus 19 Partnern von 7 deutschen Universitäten und 2 außeruniversitären Einrichtungen.
Gesamtfördermittel:
Koordinierende Institution:
Institut für Nutztierwissenschaften und Technologie (NTT) Details von NTT
Bereichsleiter:
- Leibniz Institut für Nutztierbiologie
Details von Leibniz Institut für Nutztierbiologie
Verbundprojekt 1 - Integrative Bioinformatik - Leibniz Institut für Nutztierbiologie
Details von Leibniz Institut für Nutztierbiologie
Verbundprojekt 2 - Phänotypisierung des Verhaltens - Genzentrum München
Details von Genzentrum München
Verbundprojekt 3 - Integration der OMICS - Ebenen - Leibniz Institut für Nutztierbiologie
Details von Leibniz Institut für Nutztierbiologie
Verbundprojekt 4 - Validierung der neuen Phänotypen - Institut für Tierzucht und Tierhaltung
Details von Institut für Tierzucht und Tierhaltung
Verbundprojekt 5 - Implementierung der neuen Phänotypen
Teilprojekte
Verbundprojekt 1 - Integrative Bioinformatik
- Animal Trait Ontology - Merkmalsontologie für die Bereiche Verhalten und Wohlbefinden und Projektdatenbank - Detailsvon Animal Trait Ontology - Merkmalsontologie für die Bereiche Verhalten und Wohlbefinden und Projektdatenbank
- Bioinformatik Pipeline zur Integration von Hochdurchsatzdaten und geno-/phänotypischen Parametern in Netzwerk und PNFL Systemmodelle für Rind und Schwein - Detailsvon Bioinformatik Pipeline zur Integration von Hochdurchsatzdaten und geno-/phänotypischen Parametern in Netzwerk und PNFL Systemmodelle für Rind und Schwein
- Statistische Analyse von Assoziationen zwischen Einzelnukleotidpolymorphismen und Genexpressionen - Detailsvon Statistische Analyse von Assoziationen zwischen Einzelnukleotidpolymorphismen und Genexpressionen
- Ableitung von Biosignaturen unter Ausnutzung netzwerk-topologischer a-priori Informationen und Profilen verschiedener Ebenen der Genexpression - Detailsvon Ableitung von Biosignaturen unter Ausnutzung netzwerk-topologischer a-priori Informationen und Profilen verschiedener Ebenen der Genexpression
Verbundprojekt 2 - Phänotypisierung des Verhaltens
- Modellentwicklung zur 'Animal Welfare'-Abbildung bei Rind und Schwein - Detailsvon Modellentwicklung zur 'Animal Welfare'-Abbildung bei Rind und Schwein
- Beeinflussende Faktoren der Verhaltensausprägung beim Schwein - Detailsvon Beeinflussende Faktoren der Verhaltensausprägung beim Schwein
- Analyse des Aggressions- und Sozialverhaltens beim Schwein - Detailsvon Analyse des Aggressions- und Sozialverhaltens beim Schwein
- Analyse individueller Verhaltensmuster (Temperament) beim Rind - Detailsvon Analyse individueller Verhaltensmuster (Temperament) beim Rind
Verbundprojekt 3 - Integration der OMICS - Ebenen
- Integrative OMICS-Profile zur Definition neuer Phänotypen mit Relevanz für die Merkmalskomplexe Stoffwechsel und Fruchtbarkeit bei Rind und Schwein - Detailsvon Integrative OMICS-Profile zur Definition neuer Phänotypen mit Relevanz für die Merkmalskomplexe Stoffwechsel und Fruchtbarkeit bei Rind und Schwein
- Integrative OMICS-Profile ausgewählter relevanter Gewebe von Rindern mit differenter Ausprägung von Milchleistung und Verhalten - Detailsvon Integrative OMICS-Profile ausgewählter relevanter Gewebe von Rindern mit differenter Ausprägung von Milchleistung und Verhalten
- Ingrative OMICS-Profile ausgewählter relevanter Gewebe von Schweinen mit differenter Wachstumleistung und Muskelfleischzusammensetzung - Detailsvon Ingrative OMICS-Profile ausgewählter relevanter Gewebe von Schweinen mit differenter Wachstumleistung und Muskelfleischzusammensetzung
- OMICS-Profile zur Ableitung neuer Selektionskriterien zur Reduktion von Aggression und Verbesserung der Tiergesundheit beim Schwein - Detailsvon OMICS-Profile zur Ableitung neuer Selektionskriterien zur Reduktion von Aggression und Verbesserung der Tiergesundheit beim Schwein
- Die OMICS-Verfahren in der Gesundheitsdiagnostik bei Rind und Schwein - Detailsvon Die OMICS-Verfahren in der Gesundheitsdiagnostik bei Rind und Schwein
Verbundprojekt 4 - Validierung der neuen Phänotypen
- Spezifizierung, Qualifizierung und Validierung prognostischer Parameter für Ressourceneffizienz, Gesundheit und Wohlbefinden beim Schwein - Detailsvon Spezifizierung, Qualifizierung und Validierung prognostischer Parameter für Ressourceneffizienz, Gesundheit und Wohlbefinden beim Schwein
- Spezifizierung, Qualifizierung und Validierung prognostischer Biosignaturen für Milchleistungs-, funktionale und Verhaltensmerkmale beim Rind - Detailsvon Spezifizierung, Qualifizierung und Validierung prognostischer Biosignaturen für Milchleistungs-, funktionale und Verhaltensmerkmale beim Rind
- Merkmalsassoziation der Biomarker bei verschiedenen Rinder- und Schweinerassen in unterschiedlichen Produktionsverfahren - Detailsvon Merkmalsassoziation der Biomarker bei verschiedenen Rinder- und Schweinerassen in unterschiedlichen Produktionsverfahren
- Merkmalsassoziation der Biomarker bei verschiedenen Fütterungseinflüssen - Detailsvon Merkmalsassoziation der Biomarker bei verschiedenen Fütterungseinflüssen
- Robustheit und Merkmalsassoziation der Biosignaturen unter den Bedingungen einer Erregerinfektion - Detailsvon Robustheit und Merkmalsassoziation der Biosignaturen unter den Bedingungen einer Erregerinfektion
Verbundprojekt 5 - Implementierung der neuen Phänotypen
- Entwicklung von modifizierten ,genomic selection'-Modellen - Detailsvon Entwicklung von modifizierten ,genomic selection'-Modellen
- Aufbau einer Marker-gestützten Selektionsplattform - Detailsvon Aufbau einer Marker-gestützten Selektionsplattform
- Verfahren zur optimalen Anpaarungsplanung (mate selection) zur Nutzung SNP-basierter Schätzungen nicht-additiver Geneffekte - Detailsvon Verfahren zur optimalen Anpaarungsplanung (mate selection) zur Nutzung SNP-basierter Schätzungen nicht-additiver Geneffekte
- Entwicklung eines multidimensionalen Bewertungssystems für die Tiergerechtigkeit mit Hilfe der Multi-Criteria-Analyse (MCA) - Detailsvon Entwicklung eines multidimensionalen Bewertungssystems für die Tiergerechtigkeit mit Hilfe der Multi-Criteria-Analyse (MCA)
- Validierung des entwickelten ,Multi-Criteria-Analyse'-Systems zur Optimierung tiergerechter Haltungssysteme - Detailsvon Validierung des entwickelten ,Multi-Criteria-Analyse'-Systems zur Optimierung tiergerechter Haltungssysteme


