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MRI - Institut für Ernährungs- und Lebensmittelmikrobiologie - Kiel (MRI-ELM)
Einrichtung
Abschnittsübersicht
Beschreibung
Das Institut für Ernährungs- und Lebensmittelmikrobiologie widmet sich den Wechselbeziehungen von Ernährung, Lebensmittelinhaltsstoffen und Mikrobengemeinschaften im menschlichen Körper, insbesondere im Darmmikrobiom. Die Forschungsarbeiten adressieren die Wirkung sowohl einzelner Lebensmittelinhaltsstoffe als auch gesamter Ernährungsmuster auf die Darmmikrobiota. Mithilfe moderner Methoden aus der Molekularbiologie und Bioinformatik, zum Beispiel Genomsequenzierung, können Mikroorganismen auf Ebene des Erbguts zuverlässig identifiziert werden. Zudem werden neue Nachweismethoden in diesem Bereich entwickelt. Einen weiteren Forschungsschwerpunkt bilden die mikrobiologische Sicherheit und Qualität von Lebensmitteln entlang der Wertschöpfungskette. Der Fokus liegt dabei auf dem Einsatz, der Charakterisierung und dem Nachweis von Mikroorganismen und lebensmittelassoziierten Viren. So werden etwa die Auswirkungen von Reduktionsstrategien oder Schutzkulturen auf die mikrobielle Vielfalt oder das Vorkommen von verderbsrelevanten und pathogenen Bakterien in Lebensmitteln betrachtet. Untersucht wird auch, wie Bakteriophagen als spezifische Biokontrollwerkzeuge in Lebensmitteln eingesetzt werden können, um Verderbnis- und Krankheitserreger zu inaktivieren.
Aktivitäten
- Forschung
Übergeordnete Institution
Max Rubner-Institut - Bundesforschungsinstitut für Ernährung und Lebensmittel (MRI)
Ausgeführte Projekte
- Analyse der Mikroflora deutscher Rotschmierekäse unter besonderer Berücksichtigung Antibiotika-resistenter Kontaminanten
- Analyse hofseitiger Einflussfaktoren auf die Pseudomonas-Keimzahl in Rohmilch
- Antibiotikaresistente Bakterien in der Lebensmittelkette.
- Antibiotikaresistenzen von Bakterien aus Lebensmitteln
- Applikation der Durchflusszytometrie in der Lebensmikrobiologie
- Bakteriophagen Kompetenzzentrum
- Bakteriophagen-Monitoring in milchwirtschaftlichen Betrieben
- Bestimmung der optimalen Nacherntebehandlung zur Haltbarmachung von afrikanischen Blattgemüse
- Biodiversität und Funktionalität bei Lebensmittelfermentationen
- Einfluss einer Phageninfektion auf das Metabolom von Milchprodukten nach Fermentation mit einer Leuconostoc-Aromakultur
- Einfluss nicht-nutritiver Süßungsmittel auf den humanen Gastrointestinaltrakt und Möglichkeiten zur Reduktion potenziell unerwünschter physiologischer Effekte in Milchprodukten
- Einsatz von Milchsäurebakterien und antagonistisch wirkenden Bakterien als Schutzkulturen zur mikrobiologischen Sicherheit pflanzlicher und tierischer Lebensmitteln
- Einsatz von Phagen zur Biokontrolle von antibiotikaresistenten und/oder pathogenen Bakterien sowie Verderbniserregern in Lebensmitteln
- Einsatz von Phagen zur Biokontrolle von antibiotikaresistenten und/oder pathogenen Bakterien sowie Verderbniserregern in Lebensmitteln
- Elektronenmikroskopische Feinstrukturanalyse der Besiedlung und Veränderung fermentierter Lebensmittel durch Mikroorganismen und deren Wechselwirkungen
- Entwicklung funktioneller Starterkulturen mit höherwertigen und gesundheitsfördernden Eigenschaften zur Produktion des traditionell fermentierten Milchprodukts 'Nono'
- Entwicklung und Evolution von Lactococcus and Leuconostoc Bakteriophagen in Molkereien bei Einsatz von undefinierten Starterkulturen – ein metagenomischer Ansatz
- Entwicklung von Milchsäurebakterien-Starterkulturen für den Einsatz in Obst und Gemüsefermentationen
- Entwicklung von Schutzkulturen für mildsaure Feinkostsalate
- Erfassung und Bewertung des phagenvermittelten Gentransfers in Starterkulturen
- Erhöhte Phagensicherheit in Molkereien durch hochspezifische molekulare Phagen-Nachweissysteme und eine orthogonale Prozessstrategie zur Phagenreduktion in Molke
- Ernährung und Mikroorganismen des Verdauungstraktes: a) Probiotische Bakterien in der Ernährung und Stabilisierung des Verdauungstraktes; b) Modulation des Fremdstoff-Metabolismus durch protektive Milchsäurebakterien; c) Funktionalität probiotischer Stämme
- Freisetzung bioaktiver Peptide aus Milchprotein durch proteolytische Enzyme von Milchsäurebakterien
- Freisetzung bioaktiver Peptide aus Milchprotein durch proteolytische Enzyme von Milchsäurebakterien und Klonierung und Expression zweier zellwandgebundener Proteasen (Teilprojekt LactoMic)
- Funktionelle und molekularbiologische Charakterisierung des Lysogeniemoduls temperenter Phagen der Milchsäurebakterien
- Genom-, Mikrobiom- und Transkriptom-Analysen von Lebensmittelassoziierten Mikroorganismen
- Genomanalyse von Bakteriophagen und deren Wirts-Kulturen zur Bewertung ihrer Phagenresistenz-Mechanismen
- Humanpathogene in der Lebensmittelkette Salat: Vorkommen, Eintragswege und Möglichkeiten der Kontrolle mittels Bakteriophagen
- Identifizierung und Charakterisierung funktioneller Eigenschaften von Probiotika in bezug auf ihre physiologischen Wirkungen
- Inaktivierung von Brucella spp. bei der Kurzzeiterhitzung von Milch
- Inaktivierung von Brucella spp. bei der Kurzzeiterhitzung von Milch
- Isolierung und Charakterisierung von Phagen aus Molkereien, Milchprodukten und der Umwelt und deren Aufnahme in eine Stammsammlung
- Isolierung und Charakterisierung von Phagen aus Molkereien, Milchprodukten und der Umwelt und deren Aufnahme in eine Stammsammlung
- Kohortenbasierte Erhebung der Kühlschranktemperatur in Privathaushalten in Deutschland
- Kompetitive Hemmung humanpathogener Bakterien mit dem probiotischen Stamm SF68
- Konservierung und Sammlung sicherheits-, verderbs- und ernährungsrelevanter Mikroorganismen (Genetische Ressourcen) inkl. molekulare Typisierung und Charakterisierung pathogener und toxinogener Mikroorganismen
- Lebensmittel- und Darmmikrobiota
- Lebensmittel- und Darmmikrobiota
- Massenspektrometrische Analyse der Mikrobiom-abhängigen Metabolitenprofile sowie deren Beeinflussung durch Ernährungsformen mit einem hohen Anteil an sekundären Pflanzenstoffen
- Methodenoptimierung zur Charakterisierung der Verstoffwechselung alternativer Proteine durch die humane Darmmikrobiota
- Mikrobiologischer Status von Fleischersatzprodukten
- Mikrobiologischer Status von Fleischersatzprodukten
- Mikrobiom von Leguminosen
- Mykotoxine und Mikroomyceten: Charakterisierung und Selektion gesundheitlich unbedenklicher Schimmelpilze für den Einsatz im Lebensmittelbereich
- Nachweis und Typisierung von Bakteriophagen in Rohmilch zur Erarbeitung neuer molekularer Schnellmethoden
- Nachweis von Shigatoxin-bildenden E. coli in Getreide-Proben der Besonderen Ernte- und Qualitätsermittlung
- Optimierung von Hygienemaßnahmen zur Bekämpfung von Listeria monocytogenes in Fleisch erzeugenden Betrieben
- Optimierung von Nachweisverfahren und qualitativer und quantitativer Nachweis von Mikroorganismen in Milch und Milchprodukten
- Phagen zur zielspezifischen Darmmikrobiotika-Behandlung
- Prionforschung - Lebensmittel- und Umweltsicherheit: Entwicklung eines hochsensitiven Immunnachweises zur Detektion von ZNS-Gewebe unterschiedlicher Tierarten in Lebensmitteln und Kontaminationsgeweben bei der Schlachtung/Zerlegung (Verbundprojekt im Rahm
- Schnellidentifizierung psychrophiler Pseudomonaden aus Rohmilch mittels MALDI-TOF MS
- Schnellidentifizierung psychrophiler Pseudomonaden aus Rohmilch mittels MALDI-TOF MS (PseudoID)
- Selektive Detektion von Bakterien in Rohmilch mittels Durchflusszytometrie
- Shigatoxin-bildende E. coli in der Lebensmittelkette Mehl
- Tenazitätsstudie im Hinblick auf pathogene Mikroorganismen; Mykotoxinbelastung schimmelpilzgereifter Produkte
- Translationale Evolutionsforschung (TransEvo): Charakterisierung der Unterschiede in der Zusammensetzung von Enterobacteriaceae (Enterobakterien) in Abhängigkeit vom FUT2-Genotyp des Wirts
- Translationale Evolutionsforschung: Tandemprojekt 5: Charakterisierung von Zusammenhang des humanen FUT-2 Gens und Darmgesundheit, Teilprojekt: Beziehung zwischen Diversität von Darm-assoziierten Lactobacillen und Fut-2 Genotyp des Wirtes
- Untersuchung der Transkriptionsaktivität von Listeria monocytogenes Stämmen im viable but non culturable (VBNC) Stadium
- Untersuchungen zum Vorkommen und Wirkung von bovine meat and milk factors (BMMF) und anderer zirkulärer ssDNA in Lebensmitteln
- Untersuchungen zur genotoxischen Wirkung von anorganischen Nanopartikeln in Säugetierzellen
- Untersuchungen zur mikrobiologischen Wirksamkeit von Natriumnitrit bei Rohwursterzeugnissen
- Verbundprojekt: Anpassung mikrobiologischer Qualitätsbestimmung bei Rohmilch an moderne Produktionsbedingungen durch Entwicklung und Integration innovativer Schnellmethoden. Teilprojekt 1
- Verbundprojekt: Die wirtschaftliche Bedeutung der Direktvermarktung von Rohmilch über Ausgabeautomaten für landwirtschaftliche Betriebe in Deutschland. Teilprojekt 1
- Verbundprojekt: Entwicklung innovativer produktionsintegrierter mikrobiologischer Stufenkontrollsysteme in der Fleischerzeugung zur Reduktion von Campylobacter spp. und Salmonella spp. (InnoStep) - Teilprojekt 1
- Vergleichende Untersuchungen zu antibiotikaresistenten, pathogenen Bakterien von pflanzlichen und tierischen Lebensmitteln aus Nigeria und Deutschland
- Vergleichende Untersuchungen zum Schnellnachweis von Listeria monocytogenes in Lebensmitteln mittels molekularbiologischer Methoden und chromogener Medien
- Viren in Lebensmitteln – Ein zweischneidiges Schwert hinsichtlich der mikrobiologischen Sicherheit
- Vorkommen, Aktivität und Nachweis von lipolytisch aktiven Acinetobacter spp. Verderbniserregern als Beitrag zur Qualitätsbestimmung der Rohmilch
- Zoonose- und Lebensmittelinfektionserreger: Tenazität und Verhalten von pathogenen Bakterien in Lebensmitteln tierischer Herkunft sowie Maßnahmen zur Risikominimierung inkl. Hürdenkonzeption für sichere Lebensmittel
- Zoonose- und Lebensmittelinfektionserreger: Vorkommen, Eintragsquellen und Kontaminationswege von pathogenen Bakterien (u.a. Salmonella spp, verotoxinbildende E. coli-VTEC/EHEC, Listeria monocytogenes etc.) in Lebensmitteln tierischer Herkunft bzw. den Produktionsprozess von Lebensmitteln
An Forschungsprojekten beteiligt
- Antibiotikaresistente Bakterien in der Lebensmittelkette.
- Antibiotikaresistenzen – Herstellungskette Käse
- Entwicklung einer anti-listeriellen, frühen Oberflächenreifungskultur für geschmierte Käse
- Entwicklung und Optimierung von Schnellmethoden, inklusive matrixbezogener Probenaufbereitung, zur Identifizierung von Mikroorganismen (qualitativ, quantitativ) und zum Ersatz von langwierigen kulturellen Methoden
- Erhöhte Prozesssicherheit durch eine an das Suspensionsmedium adaptierte thermische Inaktivierung von Bakteriophagen
- Ernährung und intestinale Mikrobiota
- Ernährungsphysiologische und gesundheitliche Bedeutung funktioneller Lebensmittel.
- Etablierung und Standardisierung von Mikrobiota-Analysen
- Forschung zu Antibiotikaresistenzen bei fleischassoziierten Mikroorganismen
- Hartkäse aus Rohmilch mit geschmierter Oberfläche und Listerienkontamination
- Heterozyklische aromatische Amine: Mikrobieller Metabolismus und Interaktion mit Ballaststoffen aus Obst und Gemüse
- Humanpathogene in der pflanzlichen Erzeugung: Status quo, Dekontamination, Eintragswege und Einfluss der Lagerungsbedingungen
- Identifizierung fleischrelevanter Mikroorganismen und deren Zusammenwirken und Interaktion bei Reifung und Verderb (Systembiologie, Transcriptomics, Metagenomics….)
- Inaktivierung von Leuconostoc-Phagen: Bewertung der an das Suspensionsmedium adaptierten Thermostabilität von Leuconostoc-Phagen als Grundlage für eine verbesserte Prozesssicherheit
- Lebensmittel- und Darmmikrobiota
- Literaturstudie zum Mindesthaltbarkeitsdatum (MHD)
- MHD (Mindesthaltbarkeitsdatum) von Milchprodukten
- Mikrobiologische Sicherheit von Rohwurstprodukten - Wirkung von Nitrit und Pflanzenextrakten auf enterohämorrhagische Escherichia coli und Salmonella spp.
- Minimierung der Phagenbelastung in Molke und Molkeprodukten durch Membranfiltration
- Molekulare Grundlagen der Wirkungen von Lebensmittel auf Gastrointestinaltrakt und Immunsystem
- Qualitative und quantitative Forschung zur Mikrobiota (Starterkulturen, Verderbserreger, Pathogene) von Fleisch als leichtverderblichem Lebensmittel und Fleischerzeugnissen über die gesamte Lebensmittelkette
- Rohmilchgüte und Milchgüterecht
- Schnellnachweis von Escherichia coli in der Lebensmittelproduktion durch Biochips auf 16S ribosomaler RNA-Basis
- Steigerung der Süßkraft von Lactose durch enzymatische Hydrolyse und Isomerisierung der Glucose
- Steigerung der Süßkraft von Lactose durch enzymatische Hydrolyse und partielle Isomerisierung der Glucose
- Strategien zur Salzreduzierung bei Schnittkäse
- Studie zum Einfluss von Herstellungs- und Verarbeitungsprozessen auf den Jodgehalt von Lebensmitteln bei der Verwendung von jodiertem Speisesalz
- Übergang von Aflatoxin aus natürlich kontaminierten Futtermitteln in Milch und Milchprodukten
- Untersuchungen zum Einfluss der Probenahme auf die Gehalte von Dioxinen und PCB in Fisch
- Untersuchungen zur Wirkung von in verschiedenen Matrices (Lebensmitteln sowie mit gastointestinalen Fluiden inkubierten Lebensmitteln) dispergiertem Nano-Silber auf Mikroorganismen der humanen Darmflora
Kontakt
MRI - Institut für Ernährungs- und Lebensmittelmikrobiologie - Kiel
(MRI-ELM)
Hermann-Weigmann-Straße 1
24103 Kiel
Schleswig-Holstein
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Telefon: +49 431 609-1
E-Mail: kontakt(@)mri.bund.de