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Biodiversität von Mikroorganismen im Waldboden: Kleine Pilotstudie für eine Begleituntersuchung zur BZE II
Projekt
Förderkennzeichen: BFH-II-02-39
Laufzeit: 01.07.2007
- 30.06.2008
Forschungszweck: Angewandte Forschung
In der zurzeit anlaufenden zweiten bundesweiten Bodenzustandserhebung im Wald (BZE II) werden in einem flächendeckenden Raster chemische und physikalische Bodenparameter und zahlreiche forstliche Kenngrößen erfasst. Die Biodiversität der Mikroorganismen im Waldboden soll als Begleituntersuchung zur BZE II charakterisiert werden.
Bei kulturunabhängigen Verfahren haben sich für taxonomische Zwecke der Abschnitt der 16S-rDNA bei Bakterien und Archaea und die ITS1-5.8S-ITS2-Region bei Pilzen als besonders geeignet erwiesen. Auch wenn nur ein Teil der Arten taxonomisch identifizierbar ist, bieten diese Verfahren den Vorteil, dass Mikrorganismen-Gemeinschaften ohne den modifizierenden Selektionsdruck von Nährmedien charakterisiert und verglichen werden können.
In der Pilotstudie geht es um reproduzierbare DNA-Extraktion aus Waldbodenproben, die wegen der Huminsäuren problematisch sein kann, und um die Etablierung der T-RFLP-Technik (Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism).
Abschnittsübersicht
Fachgebiete
- Forstwirtschaft
- Bodenkunde