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Errichtung der Next Generation Sequenzierung für die Genomanalyse von bakteriellen Erregern in Europa
Projekt
Förderkennzeichen: BfR-BIOS-08-1322-639
Laufzeit: 01.01.2016
- 31.12.2018
Forschungszweck: Projektvorbereitende Maßnahme
Das Ziel ist es, die Zusammenarbeit zwischen den öffentlichen Gesundheitseinrichtungen, dem Lebensmittel- und Veterinärsektor in der Europäischen Union (EU) für den Aufbau und der Verbesserung der Nutzung von Echtzeit-Sequenzierung ganzer Genome (WGS) und ihre Analyse zur Verbesserung der Lebensmittelsicherheit und dem Schutz der öffentlichen Gesundheit zu etablieren. Kooperationen sollen aufgebaut werden, um die wissenschaftliche Zusammenarbeit zu den führenden Lebensmittel-, Veterinär- und Gesundheitseinrichtungen in ganz Europa zu fördern. Das Projekt wird 'proof of concepts' durchführen, um 1) Die Evolution und genetische Vielfalt von Bakterien, angetrieben durch ihren genetischen Austausch, Selektion und ihre klonalen Expansion, zu untersuchen, 2) epidemiologische Beziehungen zwischen den Zielmikroorganismen zu beschreiben, 3) biologisch erfolgreiche mikrobielle Klone zu identifizieren, und 4) mikrobielle Virulenz-, Resistenzgendeterminanten und andere mutmaßliche Marker in verschiedenen epidemischen Stämmen von Verotoxin bildenden E. coli (VTEC) und Salmonella in Europa zu charakterisieren. Dieses Sonderforschungsprojekt soll die Mitfinanzierung von Verbrauchsmitteln für das seit Januar 2016 international geförderte Projekt ENGAGE „Establishing Next Generation sequencing Ability for Genomic analysis in Europe“ – GP/EFSA/AFSCO/2015/01/CT1 ermöglichen.
Abschnittsübersicht
Fachgebiete
- Genetische Ressourcen
- Lebensmittelmikrobiologie
- Toxikologie