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Verbundprojekt: Validierung eines PCR basierten Lab-on-a-Chip-Systems für die Diagnose von Phytophthora-Arten (PhytoChip-Validierung) - Teilprojekt 3
Projekt
Förderkennzeichen: 2815408310
Laufzeit: 01.10.2011
- 30.09.2014
Fördersumme: 177.757 Euro
Forschungszweck: Experimentelle Forschung
Die Detektion und spezifische Identifizierung pathogener Schadorganismen an Pflanzen erfolgt momentan überwiegend im Labor. Das heißt, wenn ein begründeter Verdacht für den Befall einer Pflanze mit einem geregelten Schadorganismus vorliegt, müssen die Proben in speziell ausgerüstete Labore gesendet werden. Bis zum Abschluss der Untersuchungen, sind die Pflanzen für den Handel gesperrt. Neben einem sehr hohen Zeitaufwand, geht diese Prozedur mit erheblichen wirtschaftlichen Verlusten einher. Das Ziel des Verbundvorhabens bestand daher in der Entwicklung und Erprobung eines geeigneten Lab-on-a-Chip Systems zum spezifischen Nachweis von neun bedeutenden, zum Teil als Quarantäne-Organismen geregelte/eingestufte Phytophthora-Arten. Dafür wurden die Aufarbeitung unterschiedlicher pflanzlicher Materialien und die DNA-Extraktion sowie eine sich anschließende PCR zur Vervielfältigung und Markierung einzelsträngiger Erreger-DNA und die Hybridisierung auf einem Biochip optimiert. Für neun artspezifische Fängersonden im Bereich des Ypt1 kodierenden Gens und eine weitere Gattungssonde wurden in umfangreichen Experimenten die Spezifität und Sensitivität des Systems demonstriert. Durch die Verknüpfung der unterschiedlichen Prozessschritte konnte ein geeignetes Labormuster umgesetzt werden.
Abschnittsübersicht
Fachgebiete
- Pflanzenzüchtung
