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Verbundprojekt: DC CATVI Diagnosechip for Computer-Aided Thrips and Virus Identification – Entwicklung, Erprobung und Herstellung eines Diagnosechips als Bestandteil eines innovativen, durch multimediale Computertechnik unterstützten Werkzeuges – Teilprojekt 1
Projekt
Förderkennzeichen: 2815304507
Laufzeit: 01.08.2009
- 30.04.2013
Fördersumme: 90.092 Euro
Forschungszweck: Experimentelle Forschung
Hauptziel des Projektes ist die Entwicklung eines Biochiparrays, mit dem eine Multiplexanalyse von Schaderregern jedes Entwicklungsstadiums (Ei-, Larval-, Präpuppen- und Puppenstadien sowie adulte Thripse) einschließlich der durch sie übertragenen Tospoviren möglich sein wird. Im Modul 1 wird durch Fang, DNA-Extraktion und Integument-Präparation die Basis für den visuell-diagnostischen LucID3.4-Key mit gelegt. Im Modul 2 werden durch geeignete Primerpaare die ITS1- /ITS2-Regionen amplifiziert und mit Restriktionsenzymen in Fragmente unterteilt. Diagnostisch effiziente Daten werden in einer Datenbank zur Online-Identifikation bereit gestellt. Im Modul 3 erfolgen die Sequenzierung des Thrips- und Virusmaterials sowie die Ermittlung besonders heterogener Nukleotidsequenzen und der damit in Zusammenhang stehende Entwurf, Testung und Optimierung der komplementären Oligonukleotidsequenzen. Der entwickelte elektronische Protobiochip sowie die vorliegende ID-Software mit molekularer Online-Identifikation sind als Diagnosewerkzeuge in den verschiedensten praxisrelevanten Bereichen sowie in der Forschung zur exakten, kostengünstigen und schnellen, aber auch flexiblen 'Vor-Ort'-Diagnose von Thripsen und Tospoviren modular einsetzbar.
Abschnittsübersicht
Fachgebiete
- Pflanzenschutz
- Biotechnologie