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Organisation eines Ringversuchs zur Authentifizierung von Pflanzenproben mittels DNA-Barcoding
Projekt
Förderkennzeichen: MRI-NRZ-08-2021-63
Laufzeit: 01.07.2021
- 31.03.2022
Forschungszweck: Experimentelle Forschung
Im Rahmen der § 64 LFGB AG „Molekularbiologische Methoden zur Pflanzen- und Tierartendifferenzierung“ soll ein Ringversuch zur Authentifizierung von Pflanzenproben mittels DNA-Barcoding durchgeführt werden. Das NRZ-Authent übernimmt in Zusammenarbeit mit CVUA Freiburg die Organisation des Ringversuchs, wird am Ringversuch selbst teilnehmen und anschließend die Auswertung des Ringversuchs durchführen. Insgesamt sollen im Ringversuch die Barcode-Sequenzen für sechs verschiedene genetische Marker bei fünf verschiedenen Pflanzenarten durch eine Polymerase-Kettenreaktion (PCR) mit anschließender Sanger-Sequenzierung bestimmt werden. Die ermittelten DNA-Sequenzen werden mit den Sequenzen in der öffentlichen Nukleotid-Datenbank GenBank und bei zwei Markern zusätzlich in der Barcode of Life Data (BOLD)-Datenbank abgeglichen, um die Spezies der Pflanzenproben zu ermitteln. Ziel des Ringversuchs ist schließlich die Verabschiedung einer Versuchsvorschrift für die Amtliche Sammlung von Untersuchungsverfahren nach § 64 LFGB. Zunächst wird das NRZ-Authent Vorversuche durchführen, um die Eignung eines der ausgewählten genetischen Marker (ITS1) zu überprüfen, für den bisher in der Unterarbeitsgruppe Pflanzen-Barcoding keine experimentellen Daten ermittelt wurden. Gleichzeitig wird das NRZ-Authent einen Entwurf der Versuchsvorschrift sowie eine Anleitung für die Teilnahme am Ringversuch erstellen. An der Beschaffung der Pflanzenproben, der DNA-Extraktion sowie der Kodierung der Ringversuchsproben ist das NRZ-Authent nicht beteiligt. Die Auswertung des Ringversuchs geschieht in enger Absprache mit den Mitgliedern der UAG Pflanzen-Barcoding und umfasst einerseits den Vergleich der Ergebnisse der von den Teilnehmerinnen und Teilnehmern ermittelten Datenbank-Abfragen und zusätzlich die Generierung von Konsensus-Sequenzen der einzelnen genetischen Marker sowie deren abschließende Auswertung durch Datenbank-Abfragen in GenBank und BOLD. Das Projekt gehört zur Daueraufgabe Unterstützung der amtlichen Überwachung bei der Methodenvalidierung ggf. für die Übernahme in die ASU nach § 64 LGFB innerhalb des Themenfeldes Tier-/Pflanzenarten (ggf. Rassen & Sorten) unter dem Aufgabenfeld Analytische Methoden für die Lebensmittel-Authentizitätskontrolle.
Abschnittsübersicht
Fachgebiete
- Biotechnologie
- Informatik
Rahmenprogramm
Förderprogramm
Ausführende Einrichtung
Nationales Referenzzentrum für authentische Lebensmittel (NRZ-Authent)
